Na południe Japonii leży wyspa pełna zielonej, bujnej roślinności, która zwie się Wyspą Południowego Krzyża. W znajdujących się tam podziemnych ruinach zostają odkryte zapieczętowane, ogromne, człekokształtne roboty z zapomnianych wieków. Grupa znana jako „Zakon Lśniącego Gwiezdnego Krzyża” próbuje usunąć wspomniane pieczęcie porywając Wako Agemaki – dziewczynę uważaną przez nich za „kapłankę”, osobę, która jest kluczem do uruchomienia robotów. Chłopak o imieniu Takuto Tsunashi przybywa na ratunek Wako ze swym własnym Cybuddy zwanym Tauburn.
Tak właśnie rozpoczyna się walka, aby odkryć dawne tajemnice zaawansowanych technologii oraz zapobiec nadchodzącej katastrofie.